A história do município de Morrinhos remonta a primeira metade do século 17, quando produtores rurais de Minas Gerais e de São Paulo chegaram à região atraídos pela fertilidade do solo e topografia, ideais para a criação de gado e cultivo de lavouras.
O povoado que deu origem a cidade de Morrinhos, recebeu várias denominações, Nossa Senhora do Carmo de Morrinhos, Vila Bela do Paranaíba e Vila Bela de Nossa Senhora do Carmo de Morrinhos, seu desenvolvimento foi lento, apenas em 1845 foi elevado a distrito, de 1855 a 1859 viveu um curto período como município, logo voltando à condição de distrito, somente 23 anos depois, em agosto de 1882 que foi elevado definitivamente a município, já com a denominação Morrinhos.
A partir da década de 60, a cidade experimentou uma onda maior de crescimento. Mas conseguiu se desenvolver de forma planejada. Atualmente, Morrinhos está entre as melhores cidades do Sul de Goiás, uma excelente lugar para se morar ou investir.