Na região havia uma parada de gado, que era um local de descanso e alimentação dos animais. Devido a isso, a primeira denominação da localidade foi Malhadouro, passando posteriormente para Rosália em homenagem ao pioneiro José Cândido Rosa.
A cidade ainda carrega o apelido de Biscoito Duro porque o local que era parada de lanche entre Goiânia e Rio Verde. O nome definitivo Aragoiânia foi uma escolha de José Cândido Rosa, devido à localização entre Goiânia e o Rio Araguaia. A rodovia que corta o município foi por muito tempo a principal via entre a capital e o referido rio.